[00848073]黄瓜耐低温性相关的miRNA鉴定及其调控机理研究
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MicroRNAs(miRNAs)在植物发育和胁迫响应中发挥着重要的调控作用。作为典型的喜温设施园艺作物,黄瓜对低温非常敏感。但至今只有极少量的黄瓜miRNAs被鉴定,同时有关从实验学上鉴定黄瓜miRNAs靶基因及其与miRNAs互作调控机制的研究尚未见报道。在该项目中,为了更全面广泛地鉴定黄瓜miRNAs,课题组分别构建了黄瓜叶和根的小RNA文库,并进行Solexa高通量测序,鉴定了29个已知的miRNA家族和2个新的miRNA家族。同时为了准确快速地鉴定黄瓜miRNAs靶基因,课题组通过最近刚开发的高通量降解组测序技术,首次从实验学上鉴定了21黄瓜miRNAs靶基因。在该基础上,课题组根据黄瓜耐冷品种和冷敏品种miRNAs在低温胁迫早期的差异表达谱,发现多个miRNAs家族在耐冷品种中下调表达,但在冷敏品种中却上调表达。实时定量PCR(qRT-PCR)结果进一步证实了这些miRNAs的表达模式,并发现miRNAs的表达与其对应的靶基因的表达呈负相关。这些差异表达的miRNAs为课题组揭示miRNAs介导的黄瓜耐冷性机制奠定了基础。
MicroRNAs(miRNAs)在植物发育和胁迫响应中发挥着重要的调控作用。作为典型的喜温设施园艺作物,黄瓜对低温非常敏感。但至今只有极少量的黄瓜miRNAs被鉴定,同时有关从实验学上鉴定黄瓜miRNAs靶基因及其与miRNAs互作调控机制的研究尚未见报道。在该项目中,为了更全面广泛地鉴定黄瓜miRNAs,课题组分别构建了黄瓜叶和根的小RNA文库,并进行Solexa高通量测序,鉴定了29个已知的miRNA家族和2个新的miRNA家族。同时为了准确快速地鉴定黄瓜miRNAs靶基因,课题组通过最近刚开发的高通量降解组测序技术,首次从实验学上鉴定了21黄瓜miRNAs靶基因。在该基础上,课题组根据黄瓜耐冷品种和冷敏品种miRNAs在低温胁迫早期的差异表达谱,发现多个miRNAs家族在耐冷品种中下调表达,但在冷敏品种中却上调表达。实时定量PCR(qRT-PCR)结果进一步证实了这些miRNAs的表达模式,并发现miRNAs的表达与其对应的靶基因的表达呈负相关。这些差异表达的miRNAs为课题组揭示miRNAs介导的黄瓜耐冷性机制奠定了基础。