[00301860]基于核典型相关分析的固有不规则蛋白质结构预测方法
交易价格:
面议
所属行业:
分析仪器
类型:
发明专利
技术成熟度:
正在研发
专利所属地:中国
专利号:CN201210205886.4
交易方式:
技术转让
技术转让
技术入股
联系人:
哈尔滨工程大学
进入空间
所在地:黑龙江哈尔滨市
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资料保密
对所交付的所有资料进行保密
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技术详细介绍
摘要:本发明提供的是一种基于核典型相关分析的固有不规则蛋白质结构预测方法。(1)提取待预测蛋白质的结构特征和生化特征作为识别特征,所述结构特征指采用窗口法得到的蛋白质预测位点周围氨基酸的组合频率,所述生化特征指蛋白质预测位点氨基酸的Russell/Linding值、疏水性、极性和带电性;(2)采用核典型相关分析法对所提取的特征数据进行映射和融合,获取更有利于蛋白质结构识别的特征数据,核典型相关分析法的核函数采用径向基函数;(3)基于更有利于蛋白质结构识别的特征数据,进行蛋白质结构识别和预测。本发明的预测精度得到有效提高,有助于为固有不规则蛋白质的发现和确认提供前期依据,并为生物制药的研制提供基础。
摘要:本发明提供的是一种基于核典型相关分析的固有不规则蛋白质结构预测方法。(1)提取待预测蛋白质的结构特征和生化特征作为识别特征,所述结构特征指采用窗口法得到的蛋白质预测位点周围氨基酸的组合频率,所述生化特征指蛋白质预测位点氨基酸的Russell/Linding值、疏水性、极性和带电性;(2)采用核典型相关分析法对所提取的特征数据进行映射和融合,获取更有利于蛋白质结构识别的特征数据,核典型相关分析法的核函数采用径向基函数;(3)基于更有利于蛋白质结构识别的特征数据,进行蛋白质结构识别和预测。本发明的预测精度得到有效提高,有助于为固有不规则蛋白质的发现和确认提供前期依据,并为生物制药的研制提供基础。