[00230724]一种基于支持向量机的跨膜蛋白残基作用关系预测方法
交易价格：
面议
所属行业：
分析仪器
类型：
发明专利
技术成熟度：
正在研发
专利所属地：中国
专利号：CN201310260822.9
交易方式：
技术转让
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技术入股
联系人：
中国科学院深圳先进技术研究院
进入空间
所在地：广东深圳市
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-
资料保密
对所交付的所有资料进行保密
- 如实描述
技术详细介绍
本发明涉及一种基于支持向量机的跨膜蛋白残基作用关系预测方法，所述方法包括以下步骤：步骤S100、提取用于训练的跨膜蛋白所包含的残基对特征作为训练集；步骤S200、基于SVM对所述训练集进行训练得到预测模型；步骤S300、提取待预测跨膜蛋白所包含的残基对特征作为测试集；步骤S400、将所述测试集输入所述预测模型，输出分数S；步骤S500、将S与预设阈值T进行比较，若S≥T，则判定所述待预测跨膜蛋白包含的残基对为作用对，否则判定为非作用对。本发明提出的预测跨膜蛋白残基对作用关系的方法在精确度与覆盖度上优于现有技术中的TMhit、MEMPACK以及SVMcon。
本发明涉及一种基于支持向量机的跨膜蛋白残基作用关系预测方法，所述方法包括以下步骤：步骤S100、提取用于训练的跨膜蛋白所包含的残基对特征作为训练集；步骤S200、基于SVM对所述训练集进行训练得到预测模型；步骤S300、提取待预测跨膜蛋白所包含的残基对特征作为测试集；步骤S400、将所述测试集输入所述预测模型，输出分数S；步骤S500、将S与预设阈值T进行比较，若S≥T，则判定所述待预测跨膜蛋白包含的残基对为作用对，否则判定为非作用对。本发明提出的预测跨膜蛋白残基对作用关系的方法在精确度与覆盖度上优于现有技术中的TMhit、MEMPACK以及SVMcon。
