一种甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂水乳剂,该水乳剂组分重量百分比为甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂0。1-5%,溶剂1-15%,表面活性剂1-20%,稳定剂0。1-10%,其余为水。其中不含芳香族有机溶剂,所述的甲氧基丙烯酸酯为:E-03-甲氧基-2-(2-((6-甲氧基苯并噻唑-2-基硫)甲基)苯基)丙烯酸甲酯。其制法是:将该种杀菌剂溶解在装有溶剂的均化器中;将表面活性剂加入到溶解了该种杀菌剂的溶剂中,分散均匀;将稳定剂、水加入到上述溶液中搅拌均匀即得。本发明的优点:不含芳香族有机溶剂,降低了环境污染;用低能乳化法制备简单、能耗低;该杀菌剂水乳剂液滴粒径<0。2μm、成分分散度高、均匀、稳定性高,因而提高了主剂与辅剂的使用效率。